Kolanjiyokarsinoma Proliferasyonunun Otofaji ve Hedgehog Sinyal Yolaklarının İnhibisyonu ile Azaltılması

dc.contributor.advisor Khatıb, Mona El
dc.contributor.author AKTAŞ, NİHAN
dc.contributor.author Aktaş, Nihan
dc.contributor.department AGÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyomühendislik Ana Bilim Dalı en_US
dc.contributor.institutionauthor AKTAŞ, NİHAN
dc.contributor.other 01. Abdullah Gül University
dc.date.accessioned 2020-07-22T08:10:56Z
dc.date.available 2020-07-22T08:10:56Z
dc.date.issued 2019 en_US
dc.date.issued 2019
dc.description.abstract Cholangiocarcinoma (CCA) is the second most common liver cancer type. The median survival rate of CCA patients is really low. Aberrant signaling pathways such as PI3K/AKT/mTOR pathway could be main drivers in CCA pathogenesis. Hedgehog (Hh) pathway is also dysregulated in several carcinomas including CCA. It regulates and crosstalks with autophagy, which is a lysosomal degradation process. There is no study showing the crosstalk between Hh pathway and autophagy in the context of CCA. Since both autophagy and Hh pathways are dysregulated in CCA, better understanding of how they crosstalk with each other and contribute to CCA pathogenesis is important. Considering this crosstalk between Hh pathway and autophagy, we conducted a combination treatment comprising Hh and autophagy pathway inhibitors in EGI-1 and TFK-1 CCA cell lines. In our study, we firstly checked anti-proliferative effects of Hh pathway inhibitor, GANT61, and different autophagy blockers using MTT and Annexin V assay and cell cycle analysis. After determination of IC30 of GANT61 (15 uM), chloroquine (25 uM for TFK-1 and 50 uM for EGI-1), and nocodazole (0.2 uM for EGI-1 and 0.4 uM for TFK-1), we conducted combination experiments. When we inhibit Hh pathway with targeting different steps of autophagy, we observed that proliferation of both EGI-1 and TFK-1 cells decreased compared to single treatments. After that, we checked the expression of autophagy-related LC3B protein and Akt, a negative regulator of autophagy, using western blotting after single treatments and combinational treatments. Based on the change in LC3B and Akt expression, we also concluded that, inhibition of autophagy with Hh pathway either induce or inhibit autophagy depends on the administered treatments. This study highlights the importance of deciphering the exact mechanisms that control autophagy in CCA, thus leading to better treatment.
dc.description.abstract Kolanjiokarsinoma (KKA) ikinci en yaygın karaciğer kanseri türü olarak bilinmektedir. KKA hastalarında hayatta kalma oranları olduça düşüktür. KKA patogenezinde PI3K/AKT/mTOR gibi sinyal yolaklarındaki bozuklukların temel mekanizmalardan biri olduğu düşünülmektedir. Hedgehog sinyal yolağının da KKA dahil birçok karsinogenezde bozulduğu daha önceki çalışmalarla gösterilmiştir. Hh sinyal yolağının lizozomal yıkım sürecinde rol alan otofaji sinyal yolağı ile de etkileşim halinde olduğu bilinmektedir. KKA patogenezinde Hh ve otofaji yolaklarındaki etkileşimin rolü bilinmemektedir. Bu yolaklarının KKA'da deregule edildiği de düşünülerek, bu iki sinyal yolağı arasındaki etkileşimin ve bu etkileşimin KKA patogenezindeki rolünün anlaşılması oldukça önemlidir. Bu çalışmada Hh ve otofaji yolakları arasındaki etkileşimi göz önünde bulundurarak EGI-1 ve TFK-1 hücrelerine otofaji ve Hh sinyal yolağı inhibitörlerini içeren bir kombinasyon muamelesi yapılmıştır. Çalışmamızda ilk olarak bir Hh inhibitörü olan GANT61'in ve farklı otofaji inhibitörlerinin antiproliferatif etkileri MTT, Annexin V ve hücre siklusu analizi ile ortaya konulmuştur. GANT61 (15 uM), chloroquine (TFK-1 için 25 uM ve EGI-1 için 50 uM), ve nocodazole (EGI-1 için 0.2 uM ve TFK-1 için 0.4 uM)'ün IC30 konsantrasyonları belirlendikten sonra, kombinasyon denemeleri yapılmıştır. EGI-1 ve TFK-1 hücreleri Hh inhibitörü ve otofaji yolağının farklı basamaklarını inhibe eden inhibitörlerle muamele edildiğinde, her iki kombinasyonda da hücre proliferasyonunun azaldığı gözlemlenmiştir.Hem tek bir inhibitörle hem de kombinasyonla muamele edilmiş hücrelerin otofaji bağlantılı LC3B ve otofajinin nefatif regülatörü olan Akt ifadesi western blot yöntemi ile incelenmiştir.LC3B ifadesi, Hh inhibisyonu ile birlikte otofajide hangi basamağın inhibe edildiğine bağlı olarak kombinasyonun otofajiyi tetiklediği ya da baskıladığını ortaya koymaktadır. Bu veriler CCA'da otofajiyi kontrol eden mekanizmaları ortaya koyarak, tedavisi için umut vadetmektedir. en_US
dc.identifier.other Tez No: 561804
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/20.500.12573/329
dc.identifier.uri https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=FgmkGchPKo23qQqBeqzVZqVLlYhXanGXHYbTIjSsM5sEMBdF-BTFx1rbiWUkkd6r
dc.language.iso eng en_US
dc.language.iso en
dc.publisher Abdullah Gül Üniversitesi en_US
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess en_US
dc.subject Biology en_US
dc.subject Biyoloji
dc.title Kolanjiyokarsinoma Proliferasyonunun Otofaji ve Hedgehog Sinyal Yolaklarının İnhibisyonu ile Azaltılması
dc.title The Inhibition of Autophagy and Hedgehog Pathway Leads to a Decrease in the Proliferation of Cholangiocarcinoma en_US
dc.title.alternative Kolanjiyokarsinoma proliferasyonunun otofaji ve hedgehog sinyal yolaklarının inhibisyonu ile azaltılması en_US
dc.type Master Thesis en_US
dspace.entity.type Publication
gdc.description.department Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
gdc.description.endpage 114
gdc.description.publicationcategory Tez en_US
gdc.identifier.yoktezid 561804
relation.isOrgUnitOfPublication 665d3039-05f8-4a25-9a3c-b9550bffecef
relation.isOrgUnitOfPublication.latestForDiscovery 665d3039-05f8-4a25-9a3c-b9550bffecef

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Thumbnail Image
Name:
THE INHIBITION OF AUTOPHAGY AND.pdf
Size:
2.13 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Yüksek Lisans Tezi

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
license.txt
Size:
1.71 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description: