Escherichia Coli Konak Organizmada GLP-1 Analoğunun Rekombinant Üretimi

dc.contributor.advisor Fidan, Özkan
dc.contributor.author Çalış, Burak
dc.contributor.department AGÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyomühendislik Ana Bilim Dalı en_US
dc.contributor.other 01. Abdullah Gül University
dc.contributor.other 04. Yaşam ve Doğa Bilimleri Fakültesi
dc.contributor.other 04.01. Biyomühendislik
dc.date.accessioned 2024-12-20T13:05:54Z
dc.date.available 2024-12-20T13:05:54Z
dc.date.issued 2024 en_US
dc.date.issued 2024
dc.date.submitted 2024-08-19
dc.description.abstract Diabetes is the most serious metabolic disorder correlated with obesity, hypertension and cardiovascular conditions. High prevalence of Type II Diabetes Mellitus (T2DM) indicates the need for new medication development. In developing therapeutics, higher efficiency and fewer adverse effect features are targeted primarily. Recombinant protein-based biotechnological drug molecules have been developed and used for the treatment of T2DM. Especially, GLP-1 analogues are known by their self-limiting mechanism and insulinotropic effect. In this study, a novel GLP-1 analogue with increased stability and efficiency is produced using recombinant E. coli. The expression plasmid was constructed and confirmed by restriction digestion and whole plasmid sequencing. Then, itwas transformed into various E. coli strains followed by optimized lysis, growth and expression conditions to maximize the yield of the GLP-1 analogue. Various parameters such as pre-induction time, induction point, induction IPTG concentration and post-induction temperature were tested for the succesfull expression with maximum yield. Consequently, it was achieved that E. coli BL21(DE3) as strain, 0.2 mM IPTG induction at OD600nm of 0.6 and 18 °C overnight post-induction growth was the most promising conditions. Under these conditions, the GLP-1 analogue was obtained in the insoluble fraction. Following protein analysis and purification, quantification was performed and the highest titer of GLP-1 analogue was measured as 626 µg/ml. As future prospect, using another host organism and changing growth conditions can provide obtaining target protein in the soluble form. Keywords: T2DM, GLP-1 analogue, recombinant DNA technology, protein expression, E. coli en_US
dc.description.abstract Diyabet, obezite, hipertansiyon ve kardiyovasküler hastalıklarla ilişkilendirilen en ciddi metabolik bozukluktur. Özellikle Tip II Diyabet'in yüksek prevalansı, buna karşı yeni ilaç geliştirme ihtiyacını işaret etmektedir. Geliştirilen ilaçlarda öncelikle daha yüksek verimlilik ve daha az yan etki hedeflenmektedir. Rekombinant protein temelli biyoteknolojik ilaç molekülleri bu amaç için umut vericidir. Özellikle GLP-1 analogları, kendi kendini sınırlayan mekanizmaları ve insülinotropik etkileriyle bilinmektedir. Bu çalışmada, rekombinant E. coli kullanılarak artırılmış stabilite ve verimliliğe sahip yeni bir GLP-1 analoğu üretilmiştir. Ekspresyon plazmidi, restriksiyon-ligasyon yöntemi ile oluşturulmuş ve tüm plazmit dizilimi ile doğrulanmıştır. Daha sonra, GLP-1 analoğunun verimini en üst düzeye çıkarmak için optimize edilmiş lizis, büyüme ve ekspresyon koşulları izlenerek çeşitli E. coli suşlarına transform edilmiştir. Ön indüksiyon süresi, indüksiyon noktası, indüksiyon IPTG konsantrasyonu ve indüksiyon sonrası sıcaklık gibi çeşitli parametreler, maksimum verimle başarılı ifade için test edilmiştir. Sonuç olarak, E. coli BL21(DE3) suşu, 0.6 OD600nm'de 0.2 mM IPTG indüksiyonu ve 18 °C'de gece boyunca indüksiyon sonrası büyümenin en verimli koşullar olduğu sonucuna ulaşıldı. Bu koşullar altında hedef protein GLP-1 analoğu, çözünmeyen fraksiyon halinde elde edildi. Protein analizi ve saflaştırmanın ardından kantifikasyon yapıldı ve GLP-1 analoğunun en yüksek titresi 626 µg/ml olarak ölçüldü. Gelecekteki beklentiler olarak, başka bir konak organizma kullanmak ve büyüme koşullarını değiştirmek, hedef proteinin çözünür formda elde edilmesini sağlayabilir. Anahtar kelimeler: T2DM, GLP-1 analoğu, rekombinant DNA teknolojisi, protein ekspresyonu, E. coli
dc.identifier.uri https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=UjlM15wKZGQW6TLC0pvCtwySs-0CgFHRUPm8EupEy_rcNhfxVSqI6_XDDcabjkom
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/20.500.12573/2415
dc.language.iso eng en_US
dc.language.iso en
dc.publisher Abdullah Gül Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü en_US
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess en_US
dc.subject Bioengineering en_US
dc.subject DNA-Recombinant en_US
dc.subject Glucagon-like Peptide-1 en_US
dc.subject Molecular Cloning en_US
dc.subject Biyomühendislik
dc.subject Antidiyabetikler
dc.subject DNA-Rekombinant
dc.subject Glukagon Benzeri Peptid-1
dc.subject Moleküler Klonlama
dc.title Escherichia Coli Konak Organizmada GLP-1 Analoğunun Rekombinant Üretimi
dc.title Recombinant Production of GLP-1 Analogue Using Escherichia Coli Host Organism en_US
dc.title.alternative Escherichia coli konak organizmada GLP-1 analoğunun rekombinant üretimi en_US
dc.type Master Thesis en_US
dspace.entity.type Publication
gdc.author.institutional Fidan, Özkan
gdc.description.department Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyomühendislik Ana Bilim Dalı / Biyomühendislik Bilim Dalı
gdc.description.endpage 58
gdc.description.publicationcategory Tez en_US
gdc.identifier.yoktezid 891810
relation.isAuthorOfPublication 40a61a96-7b51-46d6-97de-a02243ac945c
relation.isAuthorOfPublication.latestForDiscovery 40a61a96-7b51-46d6-97de-a02243ac945c
relation.isOrgUnitOfPublication 665d3039-05f8-4a25-9a3c-b9550bffecef
relation.isOrgUnitOfPublication 4eea69bf-e8aa-4e3e-ab18-7587ac1d841b
relation.isOrgUnitOfPublication 5519c95e-5bcb-45e5-8ce1-a8b4bcf7c7b9
relation.isOrgUnitOfPublication.latestForDiscovery 665d3039-05f8-4a25-9a3c-b9550bffecef

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Thumbnail Image
Name:
891810.pdf
Size:
1.38 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Yüksek Lisans Tezi

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
license.txt
Size:
1.44 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description: