TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/20.500.12573/396
Browse
2 results
Search Results
Article In Silico Evaluation of the Potential of Natural Products From Chili Pepper as Antiviral Agents Against DNA-Directed RNA Polymerase of the Monkeypox Virus(2024-03-24) Fidan, Ozkan; Mujwar, SomduttThis study focused on the discovery of new drug candidates effective against the monkeypox virus. Virtual screening was performed to evaluate the potential of chili pepper natural products against homology-modeled DNA-directed RNA polymerase of the monkeypox virus using molecular docking. Our findings revealed that structurally similar triterpenes such as α-amyrin, β-amyrin, and β-sitosterol had strong binding affinities towards the DNA-directed RNA polymerase and can inhibit this pivotal viral enzyme. The stability of one of the drug candidate molecules, α-amyrin with the strongest binding affinity towards the binding cavity of the enzyme was also confirmed via molecular dynamics simulation. This study showed that α-amyrin is a promising DNA-directed RNA polymerase inhibitor to treat monkeypox disease. It also paves the way for the idea of the potential dietary supplement candidate for monkeypox patients.Article Microfluidic Devices: A New Paradigm in Toxicity Studies(2020-06-15) Bosgelmez, Iffet Ipek; Yiğit, Fatma Esra; Icoz, KutaySon yıllarda, 3R (yerine koyma, azaltma, iyileştirme) prensibi doğrultusunda deney hayvanı kullanımını azaltmak için alternatif toksikoloji metotlarına (örneğin, in vitro modeller, in silico veya −omics verilerine) büyük önem verilmektedir. Bu metotlar, yeni ilaçların keşfedilmesiyle ilişkili preklinik etkinlik ve güvenliğin hızlı ve doğru bir şekilde tahmin edilmesine ve klinik çalışmalarda başarısızlık oranlarının azaltılmasına yardımcı olmaktadır. Günümüzde in vitro çalışmalar; iki boyutlu (2D) hücre kültürlerinden, doku, organ ve hatta organizmanın fizyolojisini taklit edebilen üç boyutlu (3D) hücre kültürlerine dönüşüm veya değişim içindedir. Bu bağlamda, 3D kültür modellerinin gelişmekte olan mikroakışkan teknolojilerine entegrasyonu ile çip-üstü-organ sistemleri geliştirilmiştir. Çip-üstü-organ sistemleri, ilaç araştırma ve geliştirme (Ar-Ge) sürecinde doz-yanıt ve toksisite mekanizmalarının iyi anlaşılmasını sağladığı için, ksenobiyotiklerin insan vücudu üzerindeki etkisinin tatmin edici düzeyde tahmin edilmesi mümkün olmaktadır. Ayrıca, bu sistemler farmakokinetik-farmakodinamik parametrelerin ve ilaç direncinin değerlendirilmesini destekleyebilir. Modeller, test edilen ksenobiyotiğe yanıtı incelemek için “çip-üstü-hastalık modelleri” şeklinde veya sağlıklı hücrelerle üretilebilir. Bu derleme kapsamında; çip-üstü-organ sistemlerinde kullanılan mikroakışkan sistemleri ele alınmakta ve karaciğer, böbrek, beyin, akciğer, kalp ve bağırsaklar gibi çeşitli örneklerin mikro-ortamlarının ve fizyolojik özelliklerinin çip-üstü-organ modellerine yansıtıldığı toksisite çalışmaları için potansiyelleri vurgulanmaktadır.